“十三五”时期是我国全面建成小康社会的决胜阶段，水利发展改革的总体思路是坚持创新、协调、绿色、开放、共享发展理念，创新水利资源管理体制机制，提升国家水安全保障能力和加快推进水利现代化，重点要在补短板、拓瓶颈、走后劲、上水平、促发生、惠民生的供给侧结构性改革上下功夫，到2020年基本形成与经济社会发展要求相适应的防洪抗旱减灾体系，水资源合理配置和高效利用体系，水资源保护和河湖健康保护体系，有利于水利科学发展治理体系，加快完善水利基础设施网络建设，加快推进水利基本公共服务均等化和治理体系、治理能力现代化，不断增强国家水安全保障综合能力。
随着我国经济结构转型和发展动能转换，水务领域要以改革创新为引领，加快实现从粗放用水向集约节约用水的根本性转变，以互联网和大数据为平台，实现水资源承载能力的刚性约束，坚持人口经济与环境相均衡的理念，强化需求管理，优化供给结构，以水定产，以水定成，量水而行，因水制宜，合理控制水资源开发程度，加强水资源安全风险防控和监测预警，实现水资源可持续利用，促进经济社会发展与水资源环境承载能力相协调，推动依法治水、管水发挥科技创新引领作用，全方位推进水务创新发展。加大水利重点领域和关键环节攻坚改革的力度，主要是要使发挥市场配置资源的决定性作用和更好的发挥政府作用，着力构建系统完备、科学规范、运行有效的水管理制度。
具体而言，主要任务是七方面：首先，完善水治理体制，完善流域管理与行政管理相结合的水资源管理体制，推动政府主导和社会参与的水治理体制改革，推进城乡水务一体化管理，统筹城乡水利基础设施，推进水利建设基本服务均等化，让利益相关方参与流域管理委员会。
其次，完善水价体制管理改革，通过完善农水形成机制，建立精准补贴和节约经济机制，完善计量设施措施，形成合理反映供水成本、水资源稀缺程度，有利于促进农业节水增效，实现农田水利工程良性运行的农业水价形成机制，全面形成城镇居民用水及其价格制度，非民用水超计划、超额累计加价制度，拉开高耗水行业与其他水行业差价补价，鼓励用水单位和用户之间协商定价，建立水资源有偿使用制度，研究水资源水改革。
第三，积极探索建立水权制度，建立健全用水权初始分配制度，研究制定国家水权制度改革总体方案，加快水资源使用权确权登记，水资源用途管制，使水权转让等水权制度建设，完善取水许可证制度，积极推进水资源使用、确权登记，对已发证的取水许可证进行规范，积极培育和发展水资源市场，建立水生态补偿机制。
第四是创新水利投融资机制，深化水利投融资体制改革，优化投资结构，增加有效投资，鼓励和引导社会资本参与水利工程建设，创新水利基础设施投融资体制，探索建立水利直接融资和间接融资带动更多社会资本参与水利建设，发挥水利财政资金的撬动作用，完善投资补助，贷款贴息，价格机制等支持和优惠政策，鼓励引导社会资本通过资产收购、许可经营、参股控股等多种形式参与水利工程建设运营，拓宽水利项目融资渠道，发挥水利投融资平台作用。探索允许以水利、电力供排水资产及其相关收益权等作为还款来源和合法抵押担保物，探索建立水利项目资本金融资机制。
第五是深化水利工程建设和管理体制改革。
第六是加快水利行政管理体制改革，继续推进简政放权，放管结合，优化服务，研究制定政府水管理权力清单、责任清单制度，改进水行政审批和监管方式，减少水利资质资格认定，适合行业协会承担的由其自律管理，推进投资项目涉水审计事项分类合并实施，简化政府投资水利项目立项审批程序。
第七是加大开放力度，围绕“一带一路”建设总体思路战略部署以改善提升水利基础设施，加强水生态环境保护与修复为重点，以深化周边国家跨界水合作、实施水利走出去战略，加强水利双边、多边合作为主线，为推进沿线国家交流合作，构建对方开放合作新格局，加快建设一批江河治理重点水源工程，保障区域防洪安全，加大西部地区水生态保护与修复，构建生态安全屏障，积极开展与周边国家的水务合作，切实维护我国用水权益和发展利益，努力实现合作共赢。
